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公卫助理医师《生物化学》蛋白质的化学知识

时间:2018-01-23 15:55:52 公卫执业助理医师 我要投稿

2017年公卫助理医师《生物化学》蛋白质的化学知识

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2017年公卫助理医师《生物化学》蛋白质的化学知识

  第一节 蛋白质的分子组成

  一、蛋白质的元素组成

  主要有 C、H、O、N、S。

  各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%。

  二、蛋白质的基本组成单位——氨基酸

  蛋白质在酸、碱或蛋白酶的作用下,最终水解为游离氨基酸(amino acid),即蛋白质组成单体或构件分子。存在于自然界中的氨基酸有300余种,但合成蛋白质的氨基酸仅20种(称编码氨基酸)。

  (一)氨基酸的结构通式

  组成蛋白质的20种氨基酸有共同的结构特点:

  1.氨基连接在α- C上,属于α-氨基酸(脯氨酸为α-亚氨基酸)。

  2.R是側链,除甘氨酸外都含手性C,有D-型和L-型两种立体异构体。天然蛋白质中的氨基酸都是L-型。

  (二)氨基酸的分类

  1.按R基的化学结构分为脂肪族、芳香族、杂环、杂环亚氨基酸四类。

  2.按R基的极性和在中性溶液的解离状态分为非极性氨基酸、极性不带电荷、极性带负电荷或带正电荷的四类。

  带有非极性R(烃基、甲硫基、吲哚环等,共9种):甘(Gly)、丙(Ala)、缬(Val)、亮(Leu)、异亮(Ile)、苯丙(Phe)、甲硫(Met)、脯(Pro)、色(Trp)

  带有不可解离的极性R(羟基、巯基、酰胺基等,共6种):丝(Ser)、苏(Thr)、天胺(Asn)、谷胺(Gln)、酪(Tyr)、半(Cys)

  带有可解离的极性R基(共5种):天(Asp)、谷(Glu)、赖(Lys)、精(Arg)、组(His),前两个为酸性氨基酸,后三个是碱性氨基酸。

  (三)氨基酸的重要理化性质

  1.一般物理性质

  α-氨基酸为无色晶体,熔点一般在200 oC以上。各种氨基酸在水中的溶解度差别很大(酪氨酸不溶于水)。一般溶解于稀酸或稀碱,但不能溶解于有机溶剂,通常酒精能把氨基酸从其溶液中沉淀析出。

  芳香族氨基酸(Tyr、Trp、Phe)有共轭双键,在近紫外区有光吸收能力,Tyr、Trp的.吸收峰在280nm,Phe在265 nm。由于大多数蛋白质含Tyr、Trp残基,所以测定蛋白质溶液280nm的光吸收值,是分析溶液中蛋白质含量的快速简便的方法。

  2.两性解离和等电点(isoelectric point, pI)

  氨基酸在水溶液或晶体状态时以两性离子的形式存在,既可作为酸,又可作为碱起作用,是两性电解质,其解离度与溶液的pH有关。

  在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势和程度相等,成为兼性离子,呈电中性,

  此时溶液的pH称为该氨基酸的等电点。

  3.氨基酸的化学反应

  氨基酸的化学反应是其基团的特征性反应。

  (1)茚三酮反应

  所有具有自由α-氨基的氨基酸与过量茚三酮共热形成蓝紫色化合物。

  (2)与2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应

  三、肽(peptide)

  1.肽键与肽链

  一个氨基酸的α-羧基和另一个氨基酸的α-氨基脱水形成的酰胺键称为肽键。多肽链的方向性是从N末端指向C末端。

  肽分子中不完整的氨基酸称为氨基酸残基。肽按其序列从N端到C端命名。一般10肽以下属寡肽,10肽以上为多肽。

  2.生物活性肽

  谷胱甘肽(glutathione,GSH)

  是由Glu、Cys、Gly组成的一种三肽,又叫γ-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸(含γ-肽键)。

  第二节 蛋白质的分子结构

  一、蛋白质的一级结构(primary structure)

  蛋白质一级结构是空间结构和特异生物学功能的基础。

  二、蛋白质的二级结构(secondary structure)

  蛋白质的二级结构是指其分子中主链原子的局部空间排列,是主链构象(不包括侧链R基团)。

  两种主链原子的局部空间排列的分子模型(α-螺旋)和(β-折叠)。

  1.肽单位

  肽键及其两端的α-C共6个原子处于同一平面上,组成了肽单位(所在的平面称肽键平面)。

  肽键C—N键长为0.132nm,比相邻的单键(0.147nm)短,而较C=N双键(0.128nm)长,有部分双键的性质,不能自由旋转。肽键平面上各原子呈顺反异构关系,肽键平面上的O、H以及2个α-碳原子为反式构型(transconfiguration)。

  2.α-螺旋

  α-螺旋是肽键平面通过α-碳原子的相对旋转形成的一种紧密螺旋盘绕,是有周期的一种主链构象。其特点是:

  ② 螺旋每转一圈上升3.6个氨基酸残基,螺距约0.54nm

  ②相邻的螺圈之间形成链内氢键,氢键的取向几乎与中心轴平行。

  ③螺旋的走向绝大部分是右手螺旋,残基侧链伸向外侧。R基团的大小、荷电状态及形状均对α-螺旋的形成及稳定有影响。

  3.β-折叠

  ① 相邻肽键平面间折叠成110度角,呈锯齿状。

  ② 两个以上具β-折叠的肽链或同一肽链内不同肽段相互平行排列,形成β-折叠片层,其稳定因素是肽链间的氢键。

  ③ 逆向平行的片层结构比顺向平行的稳定。

  α-螺旋和β-折叠是蛋白质二级结构的主要形式。

  4.β-转角

  5.不规卷曲

  6.超二级结构和结构域